Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NTRK2-208ENST00000395882 7111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms