Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CLDN15P56746 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CLDN15P56746 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CLDN15P56746 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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