Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD23BP54727 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1700.3 ms