Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATRXP46100 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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