Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DMAP28067 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms