Protein–RNA interactions for Protein: P19971

TYMP, Thymidine phosphorylase, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMPP19971 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TYMPP19971 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TYMPP19971 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms