Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFE3P19532 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFE3P19532 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TFE3P19532 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms