Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA4P13612 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms