Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NEFHP12036 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
NEFHP12036 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms