Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C4BP0C0L5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms