Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TYMSP04818 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TYMSP04818 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TYMSP04818 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms