Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
USP17L13C9JLJ4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USP17L13C9JLJ4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms