Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MTMR11A4FU01 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MTMR11A4FU01 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms