Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTC7AQ9ULT0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTC7AQ9ULT0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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