Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLIP2Q9UDT6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms