Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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USP35Q9P2H5 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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USP35Q9P2H5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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USP35Q9P2H5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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USP35Q9P2H5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP35Q9P2H5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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