Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSD3Q9NYI0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSD3Q9NYI0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms