Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SERINC1Q9NRX5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms