Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms