Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARFGAP3Q9NP61 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms