Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COG4Q9H9E3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms