Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ROPN1BQ9BZX4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms