Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VAMP8Q9BV40 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
VAMP8Q9BV40 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms