Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTA3Q9BTC8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTA3Q9BTC8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MTA3Q9BTC8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MTA3Q9BTC8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MTA3Q9BTC8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MTA3Q9BTC8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTA3Q9BTC8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms