Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
NICN1Q9BSH3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms