Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms