Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms