Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF548Q8NEK5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.9 ms