Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF148Q8N7C7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms