Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LNX2Q8N448 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LNX2Q8N448 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LNX2Q8N448 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LNX2Q8N448 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LNX2Q8N448 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LNX2Q8N448 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LNX2Q8N448 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LNX2Q8N448 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LNX2Q8N448 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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