Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC50Q8IVM0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms