Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SYT9Q86SS6 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SYT9Q86SS6 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SYT9Q86SS6 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SYT9Q86SS6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SYT9Q86SS6 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SYT9Q86SS6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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SYT9Q86SS6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SYT9Q86SS6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SYT9Q86SS6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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