Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MICAL3Q7RTP6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms