Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HECW1Q76N89 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms