Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CXCL17Q6UXB2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CXCL17Q6UXB2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms