Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EEF1DP3Q658K8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms