Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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SAMD13Q5VXD3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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SAMD13Q5VXD3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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SAMD13Q5VXD3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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