Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BRMS1LQ5PSV4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRMS1LQ5PSV4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms