Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms