Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL67

PARP6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP6Q2NL67 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PARP6Q2NL67 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms