Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
RTL8BQ17RB0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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