Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
IMPG1Q17R60 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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