Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NRF1Q16656 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms