Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ECM1Q16610 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECM1Q16610 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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