Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNGA3Q16281 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNGA3Q16281 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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