Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK4Q16099 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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