Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIP13Q15645 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms