Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EBI3Q14213 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EBI3Q14213 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms