Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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