Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PMS2P11Q13670 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms